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A nivel arquitectónico el museo está dominado por líneas minimalistas. Tan sólo en lo más alto se incluyeron unas claraboyas de metal y vidrio que rompen la linealidad del edificio en su cubierta. Elevadas para distribuir mejor la luz. En su interior, en lo alto del vestíbulo se encuentra la llamada "Nube Siret", en homenaje a Luis Siret, considerado como el padre de la arqueología de la prehistoria almeriense.

La colección museográfica del museo se distribuye en tres plantas. Entre la primera y la segunda encontrarás la exposición permanente dedicada a las primeras sociedades de cazadores-recolectores llamada la “sociedad de los millares” así como la exposición sobre la “sociedad de El Argar”. En ambas se pueden encontrar las herramientas empleadas en las labores del día a día, pieles, punzones, útiles de sílex, joyería, ídolos, etc... También hay un recorrido simbólico a través de los muros, que representa las terrazas artificiales sobre las que se construyeron las viviendas de “Fuente Álamo”, tumbas, e innumerables objetos de interés. La tercera planta está dedicada a los mundos romanos y el andalusí.

Además de estas exposiciones permanentes el museo cuenta con un área para exposiciones temporales desplegadas en los espacios de la tercera planta.

El museo está abierto al público de 9:00 a 20:30 horas, de martes a sábado, y de 9:00 a 15:30 horas los domingos y festivos.

Si necesitas un aparcamiento cercano al museo, dispone de un parking público Saba ubicado en la estación de Almería.